El Departamento Académico es el responsable de la programación, planificación y ejecución de las carreras que se dictan en la Escuela Superior de Guerra Conjunta de las Fuerzas Armadas.
Para tal fin, dicho Departamento cumple sus funciones específicas a través de las Áreas Estrategia, Operaciones, Administración y Ejercicios; las Direcciones de Carrera y la División Personal Docente.
La oferta educativa está relacionada con las siguientes carreras de posgrado, con títulos oficiales:
En ambos casos, los interesados deberán satisfacer competencias y requisitos de ingreso especificados en las normativas particulares del Instituto.
Las carreras de posgrado se desarrollan de manera presencial. Para la graduación como Especialista en Estrategia Operacional y Planeamiento Militar Conjunto, se requiere la aprobación de un Trabajo Final Integrador de saberes; mientras que para obtener el título de Magister, se debe defender y aprobar una Tesis de Maestría.